日前，在国家重点研发筹划和贝类财产技能体系等项目支持下，黄海水产研究所王崇明研究员团队、杨爱国研究员团队与德国阿尔弗雷德·韦格纳研究所赫尔姆霍兹极地和海洋研究中央Umberto Rosani博士等互助，乐成破译魁蚶基因组，研究结果于7月9日正式发表在GigaScience杂志。
该研究使用第二、三代测序和Hi-C染色体构象捕捉技能，构建了国际上首个染色体程度的蚶科动物基因组参考图谱。研究展现魁蚶基因组巨细为885 Mb，Scaffold N50到达45 Mb，使用Hi-C技能乐成将99.35%的组装序列挂载到染色体上，经进一步分析发现魁蚶基因组中重复序列高达408 Mb，占基因组总长的46%。
魁蚶俗称赤贝、血贝、大毛蛤，是一种大型海洋底栖经济贝类，广泛分布于平静洋西北部的日本海、黄海、渤海及东海沿岸，成贝个大要肥，肉质鲜美，经济代价较高。比年来，我国魁蚶苗种生产和增养殖规模不停扩大，经济和社会效益明显，然而其种质质量降落、病害高发等题目日趋严峻。魁蚶及蚶科贝类基因组信息的匮乏成为我们明白其抗病、抗逆机制的停滞，破译魁蚶基因组信息、开展紧张性状遗传改良成为当下的紧张课题。该项研究结果为蚶科贝类抗病抗逆、生长发育等紧张性状的遗传剖析以及种质改良等相干研究提供了紧张理论支持。
黄海水产研究所白昌明博士、辛鲁生博士为该论文的共同第一作者，王崇明研究员为该论文的通讯作者。
全文链接：Chromosomal-level assembly of the blood clam,Scapharca(Anadara)broughtonii, using long sequence reads and Hi-C
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